分子纳米探针在原发性肝癌差异表达基因分析和预后模型中的应用( Application of Molecular Nanoprobes in the Analysis of Differentially Expressed Genes and Prognostic Models of Primary Hepatocellular Carcinoma )

S Luo L Gan Y Luo Z Zhang Z Zhang

基于生物大数据分析与肿瘤发生相关的hub基因，近来成为生物医学界的热点。以纳米载体为载体的靶向hub基因的纳米探针、纳米体和靶向分子在肿瘤治疗中得到了广泛的应用。肝细胞癌(HCC)是最常见的恶性肿瘤之一，预后差，死亡率高。根据hub基因的表达水平确定hub基因，构建与肝癌发病和预后相关的预后特征具有重要意义。本研究从GEO数据库中获取HCC和正常组织的表达谱，并用GEO 2 R进行分析，以鉴定DEGS。GO术语和KEGG路径在DAVID软件中得到了丰富。通过查阅STRING数据库，发现DEGs编码的蛋白质之间的相互作用，并通过细胞镜可视化DEGs编码的蛋白质之间的相互作用。然后，通过Kaplan-Meier绘图器在线工具计算与hub基因相关的总存活率，并对TCGA样本及其相应的临床信息进行验证。共获得603个DEGs，其中479个上调，124个下调。构建PPI网络，包括603个DEG和18个簇，其中7个簇MCODE得分≥3,节点≥5。将连接度最高的5个基因确定为hub基因，并构建预后模型。TCGA临床资料验证了该模型的表达和预后潜力。结论：本研究发现inHCC有五个基因(TOP2A、PCNA、AURKA、CDC20、CCNB2)过表达，并建立了一个预后模型。该基因特征可作为肝癌的预后模型，并为纳米技术提供潜在的靶点。

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