甲基化在人类子宫内膜和血液中的基因调控和生殖疾病的基因靶点( Genetic regulation of methylation in human endometrium and blood and gene targets for reproductive diseases )

Sally,Mortlock Restuadi,Restuadi Rupert,Levien Jane E,Girling Sarah J,Holdsworth-Carson Martin,Healey Zhihong,Zhu Ting,Qi Yang,Wu Samuel W,Lukowski Peter A W,Rogers Jian,Yang Allan F,McRae Jenny N,Fung Grant W,Montgomery Blood DNA methylation DNA methylation quantitative trait loci (mQTL) Endometriosis Endometrium Menstrual cycle

在理解人类疾病的遗传风险因素的功能后果方面的主要挑战是哪些组织和细胞类型受到影响，以及合适组织的有限可用性。本研究的目的是评估妇女在月经周期不同阶段的子宫内膜和血液DNA样本的组织特异性基因型-表观遗传特征，并将结果与生殖性状和疾病的遗传危险因素联系起来。我们分析了66例欧洲妇女子宫内膜和血液样本的DNA甲基化(DNAm)数据。甲基化谱在月经周期的不同阶段进行比较，甲基化的变化与转录和基因型的变化重叠。我们观察到子宫内膜在月经周期中甲基化的巨大变化（27，262个DNAm探针），而血液中没有观察到。在子宫内膜和血液中分别检测443,016和443,101个DNAm探针的个体基因型数据与甲基化的相关性，以确定甲基化数量性状基因座（mQTLs）。在子宫内膜中检测到4546个前哨顺式MQTL(P-10)和434个前哨反式MQTL(P-12)，在血液中检测到6615个前哨顺式MQTL(P-10)和590个前哨反式MQTL(P-12)。在二次分析后，我们发现62%的子宫内膜顺式MQTL在血液中也被观察到，组织间的遗传效应高度相关。许多mQTL SNPs与生殖特性和疾病有关，其中一个位于已知的子宫内膜异位症危险区域（靠近GREB1)。我们报告了子宫内膜甲基化的遗传调控以及子宫内膜mQTL与子宫内膜异位症风险和其他生殖特性和疾病的关系的新发现。组织间遗传效应的高度相关性突出了在子宫内膜研究中利用大型mQTL数据集的潜力，并为功能研究确定目标基因。然而，组织特异性甲基化谱和遗传效应也突出了在研究疾病风险的分子机制时也使用疾病相关组织的重要性。

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