基于自噬相关基因的食管腺癌生存模型的开发和验证( Development and validation of a survival model for esophageal adenocarcinoma based on autophagy-associated genes )

Lili Duan Lu Cao Rui Zhang Liaoran Niu Liu Hong

自噬是一种高度保守的分解代谢过程，与食管腺癌(EAC)有关。本研究旨在探讨自噬相关基因（ARGs）在EAC中的生物学功能及预后价值。在EAC和正常标本中，共鉴定出21种差异表达的ARGs。应用基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析EAC中差异表达的ARGs,建立蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。采用Cox生存分析和Lasso回归分析，建立9种与总生存(OS)相关的ARGs(CAPN1、GOPC、TBK1、SIRT1、ARSA、BNIP1、ERBB2、NRG2、PINK1)的预后预测模型。在Atlas(TCGA)-EAC队列中，9个基因的预后特征显著地分层了患者的预后，并被认为是EAC患者的独立预后预测因素。此外，基因集富集分析(GSEA)分析揭示了与EAC高危人群相关的几个重要的细胞过程和信号通路。该预后预测模型在基因表达综合(GEO)数据库中的一个独立验证队列(GSE13898)中得到证实。我们还开发了一个符合指数为0.78的诺模图，通过综合风险特征和临床病理特征来预测EAC患者的生存可能性。标定曲线证实了实际观测与诺模图预测的良好一致性。最后但并非最不重要的是，Erb-B2受体酪氨酸激酶2(ERBB2)是预后基因标志的成员，被确定为EAC患者的潜在治疗靶点。总之，我们建立并验证了一个新的基于ARGs的预后预测模型，该模型可以优化EAC的个体化生存预测。

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