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基于时间的系统生物学方法捕捉和建模动态基因调控网络( Time-Based Systems Biology Approaches to Capture and Model Dynamic Gene Regulatory Networks )
JM Alvarez MD Brooks J Swift GM Coruzzi
转录及其调控的各个方面都涉及动态事件。然而，在基因调控网络(GRNs)中捕捉这些动态事件既是一个希望，也是一个挑战。希望是捕捉和建模GRNs的动态变化将允许我们理解生物体如何适应变化的环境。对环境变化进行快速转录反应的能力在植物等非能动生物中尤其重要。目前的挑战是捕捉这些动态的、全基因组的事件，并在GRNS中建模。在这篇综述中，我们涵盖了在捕捉转录因子与其靶点的动态相互作用方面的最新进展--在局部和全基因组水平上--并使用它们来了解GRNs是如何作为时间函数运行的。我们还讨论了利用基于时间的机器学习方法来预测未来时间点的基因表达的最新进展，这是系统生物学的一个关键目标。《植物生物学年度评论》第72卷的最终在线出版日期预计为2021年5月。订正估计数请见http://www.annualreviews.org/page/journal/pubdates。
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