1株产GES-1型碳青霉烯酶铜绿假单胞菌的全基因组测序分析

郭庆昕 蔡加昌 周宏伟 张嵘 蒋华蔚 胡燕燕 碳青霉烯酶 铜绿假单胞菌 bla_(GES-1) 基因环境 全基因测序

目的了解产GES-1型碳青霉烯酶铜绿假单胞菌的分子流行特征.方法采用Illumina HiSeq X10测序平台对1株产GES-1型碳青霉烯酶铜绿假单胞菌进行全基因组测序,通过Kleborate和ResFinder分析菌株的多位点序例分型(MLST),毒力基因和抗菌药物耐药基因,并分析blaGES-1基因的周围环境.结果经比对,本菌为ST235型,血清分型为O11型,共携带12个抗菌药物耐药基因,分别为aac(6′)-Ⅰb3,aadA10,aph(3′)-Ⅱb,aph(3′)-XV,bla_(GES-1),bla_(OXA-50),bla_(PAO),crpP,sul1,tet(G),fosA,catB7;bla_(GES-1)位于含有3150 bp的NODE_219片段中,该片段与GenBank中的KY860573菌株的72068—75217序列99.94%一致.其基因环境为位于上游的整合子1(intl1),β-内酰胺类耐药基因blaGES-1,氨基糖苷类/氟喹诺酮类耐药基因aac(6′)-Ⅰb3,氨基糖苷类耐药基因aph(3′)-XV及位于下游的插入序列ISPa21e.该菌包含有357个毒力基因,为exoU^(+)/exoS^(-)基因型.结论本菌为全球流行的高风险克隆ST235,exoU^(+)/exoS^(-)基因型.全基因组测序分析提供了bla_(GES-1)基因环境,基因分型,耐药基因,毒力基因等多种信息.

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