植物乳杆菌WCFS1全基因组序列

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作者：scidown 发布时间：2021-08-17 11:57:20 文章标题：

植物乳杆菌WCFS1全基因组序列( Complete genome sequence of Lactobacillus plantarum WCFS1 )

文章作者：

M Kleerebezem J Boekhorst KR Van D Molenaar OP Kuipers R Leer R Tarchini SA Peters HM Sandbrink MW Fiers Genome Bacterial Lactobacillus 基因组细菌乳杆菌属

文章简述：

从人唾液中分离的植物乳杆菌NCIMB8826菌株的单菌落分离株WCFS1的染色体序列为3308274-bp,含有3052个预测蛋白编码基因。推测的生物学功能可以分配给2120个（70%）预测的蛋白质。植物L.flantarum作为兼性异发酵乳酸菌的分类一致，基因组编码糖酵解和磷酸酮醇酶途径所需的所有酶，所有这些似乎都属于该生物中潜在的高表达基因类别，从单个基因的密码子适应指数可以看出。此外，植物L.具有很大的丙酮酸耗散潜力，导致各种发酵最终产物。L.植物是一种在许多不同的环境生态位中都能遇到的物种，这种灵活和适应的行为体现在相对较多的调节和运输功能上，包括25个完整的PTS糖运输系统。此外，染色体编码超过200种细胞外蛋白，其中许多蛋白被预测与细胞包膜结合。许多编码糖运输和利用的基因，以及编码细胞外功能的基因，似乎都聚集在复制起源附近一个600kb的区域。这些基因中的许多都显示出核苷酸组成的偏差，与外源基因一致。这些发现表明，这些基因是植物与环境相互作用的重要组成部分，在染色体上形成了一个生活方式适应区。

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