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应用免疫相关lncRNA对构建胃腺癌的预后特征和预测免疫景观( Applying immune-related lncRNA pairs to construct a prognostic signature and predict the immune landscape of stomach adenocarcinoma )
Yujiao Wang XinXing Zhang Xiaosong Dai Dingxiu He
背景:长非编码RNA(lncRNAs)与肿瘤患者的生存有关。我们构建了胃腺癌(STAD)免疫相关lncRNA(irlncRNA)对签名。研究设计和方法:通过与免疫相关基因的共表达分析鉴定irlncRNAs。差异表达的irlncRNAs(DEirlncRNAs)配对。采用最小绝对收缩选择算子(LASSO)和多元Cox比例风险回归方法构造签名。根据Akaike信息准则(AIC)计算接收机工作特性(ROC)曲线下的面积,并确定最佳截止值。将患者分为高、低危组,根据风险评分探讨组间免疫细胞浸润、肿瘤突变负担(TMB)及药物治疗效果的差异。结果:构建了一个8-irlncRNA对特征,并通过外部验证证明该特征对STAD患者的预后有较强的预测作用。此外,风险评分被确定为一个独立的预后因素。高、低风险评分患者的免疫细胞浸润及对几种药物治疗的反应有显著性差异,风险评分与TMB呈负相关。结论:8对irlncRNA对具有良好的预后预测价值。
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