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将条形码神经解剖学与空间转录谱相结合，可以识别与投射相关的基因( Integrating barcoded neuroanatomy with spatial transcriptional profiling enables identification of gene correlates of projections )
Yu-Chi Sun Xiaoyin Chen Stephan Fischer Shaina Lu Anthony M. Zador
功能回路由具有不同轴突投射和基因表达的神经元组成。要了解投射的分子特征，需要在细胞分辨率下高通量地询问基因表达和投射到同一细胞中的多个靶点，这是使用现有技术难以实现的。在这里，我们介绍BARseq2，一种通过原位测序同时绘制投射图和检测多路基因表达的技术。我们测定了小鼠运动皮层和听觉皮层中29,933个细胞的钙粘蛋白和细胞类型标记的表达和3,164个细胞的投射。通过对1349个神经元的相关基因表达和投射，揭示了两个皮层区域的同源投射的共有钙粘蛋白签名。这些钙粘蛋白在转录组分类学的多个分支中富集。通过在单个神经元中高通量地关联多基因表达和向多个靶点的投射，BARseq2为揭示神经元回路的分子逻辑提供了一条潜在的途径。Sun等人。提出了一种将内源性mRNAs原位测序与条形码轴突投射定位相结合的高通量方法BARseq2,并将其应用于两个皮层区域与类似投射相关的钙粘蛋白的鉴定。
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