肝细胞癌ncrna的CAGE分析显示，在病毒诱导的肿瘤中，逆转录病毒LTR启动子被广泛激活

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作者：scidown 发布时间：2021-08-03 10:37:30 文章标题：

肝细胞癌ncrna的CAGE分析显示，在病毒诱导的肿瘤中，逆转录病毒LTR启动子被广泛激活( CAGE profiling of ncRNAs in hepatocellular carcinoma reveals widespread activation of retroviral LTR promoters in virus-induced tumors )

文章作者：

K Hashimoto AM Suzuki AD Santos C Desterke P Carninci

文章简述：

越来越多的非编码RNA（ncRNAs）与包括癌症在内的各种人类疾病有关；然而，肝细胞癌(HCC)的ncRNA转录组在很大程度上尚未被探索。我们使用CAGE定位不同类型人和小鼠HCCs的转录起始位点，重点是远离蛋白质编码基因的ncRNAs。在此，我们报告逆转录病毒LTR启动子，表达于健康组织如睾丸和胎盘，而不是肝脏，在肝脏肿瘤中广泛激活。尽管HCC具有异质性，但在绝大多数样本中，LTR衍生的ncRNAs的一个亚群上调了10倍以上。高LTR活性的HCCs多有病毒病因，分化较低，复发风险较高。ChIP-seq数据显示MYC和MAX与ncRNA放松相关。在全球范围内，CCAGE使我们建立了一个哺乳动物肝癌启动子图谱，这揭示了肝癌基因组学的一个新的复杂性。2015桥本等人；冷泉港实验室出版社出版。

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