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通过对汇集和条形码的鼻腔和唾液样本进行下一代测序，大规模检测SARS-CoV-2 RNA( Massively scaled-up testing for SARS-CoV-2 RNA via next-generation sequencing of pooled and barcoded nasal and saliva samples )
Joshua S. Bloom Laila Sathe Chetan Munugala Eric M. Jones Valerie A. Arboleda
对没有严重急性呼吸系统综合症冠状病毒2（新型冠状病毒）症状的人口进行频繁和广泛的检测，对于减少病毒的传播至关重要。尽管最近检测能力有所提高，但基于定量聚合酶链反应(qPCR)的检测不能很容易地达到全人群筛查所需的规模。在这里，我们展示了用样本特有的分子条形码标记的集合样本的下一代测序使得在一次运行中测试数千个鼻腔或唾液样本的新型冠状病毒病毒RNA，而不需要RNA提取。我们命名为SwabSeq，它包含了一种合成RNA标准，有助于终点定量和真阴性的调用，并降低了对自动化、纯化和样本间标准化的要求。我们使用SwabSeq在不到两个月的时间内进行了80,000项测试，其分析灵敏度和特异性与传统的qPCR测试相当或更好，周转时间不到24小时。SwabSeq可用于其它病原体的快速检测。
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scidown 中国生物医学杂志，2010年4月7日;11(4):286-97。doi: 10.1016 / j.cmet.2010.03.002。研究支助，国家卫生研究院，校外;研究支持，非美国政府不下载
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