碳青霉烯耐药质粒在住院患者肠道菌群中的广泛传播( Pervasive transmission of a carbapenem resistance plasmid in the gut microbiota of hospitalized patients )

Ricardo León-Sampedro Javier DelaFuente Cristina Díaz-Agero Thomas Crellen lvaro San Millán

产碳青霉烯酶肠杆菌（carbapenemase producting enterobacteria,CPE）引起的感染是全世界临床上普遍关注的问题。两个根本不同的过程决定了CPE在医院的流行病学：CPE克隆在患者之间的传播（患者之间的转移）和编码碳青霉烯酶的质粒在单个患者肠道微生物区系中的肠杆菌之间的转移（患者内部的转移）。各过程对碳青霉烯耐药性在医院的总体传播的相对贡献仍不甚了解。在这里，我们使用结合来自9000多名患者的流行病学数据和来自250个肠杆菌克隆的全基因组序列信息的机制模型来表征一个POXA-48样碳青霉烯酶编码质粒在医院环境中2年期间的传播途径。我们的结果显示，携带POXA-48的高危克隆在患者之间频繁传播，主要是肺炎克雷伯菌和零星的大肠埃希菌。结果还确定了医院内部的pOXA-48传播热点，如特定病房和病房内的个别房间。通过高分辨率的质粒序列分析，我们发现了pOXA-48在患者体内的普遍转移，这表明水平质粒转移几乎发生在每一个定植患者的肠道中。本研究揭示的复杂和多方面的流行病学情景为制定控制CPE院内传播的干预策略提供了见解。通过对西班牙一家医院的流行病学和基因组数据分析,我们发现携带pOXA-48的高危肠杆菌克隆在患者之间频繁传播,pOXA-48质粒在患者体内水平转移。

SciDown文献求助系统（解决99%问题） Public Download ResearchGate