羊成纤维细胞对羊布鲁氏菌M5-90株应答的整合mRNA-seq和miRNA-seq分析( Integrated mRNA-seq and miRNA-seq analysis of goat fibroblasts response to Brucella Melitensis strain M5-90 )

Baobao Li Si Chen Chengqiang Wang Qiaoling Chen Fengyang Wang

布鲁氏菌病是一种全球性的人畜共患细菌性疾病，主要发生在人类和包括山羊、绵羊和牛在内的各种动物身上。布鲁氏菌M5-90是一种减毒活疫苗株，已广泛用于山羊和绵羊布鲁氏菌病的预防。然而，非专业吞噬细胞感染M5-90的保护性免疫应答的分子机制尚未得到充分的研究，特别是在山羊中。在我们的研究中，山羊成纤维细胞作为体外模型，通过转录组分析来确定这些机制。用melitensis M5-90孵育3h后，分别于0、4、24、48、72h收集感染山羊成纤维细胞进行RNA序列测定。结果表明，与对照组相比，实验组共发现11819个差异表达基因(DEGs)，777个差异表达基因(DE)miRNAs(log2(Foldchange)≥1，FDR<0.05)。GO和KEGG富集分析表明下调基因参与核黄素代谢和IL-8分泌的正调控。上调基因主要参与适应性免疫，包括TNF信号通路、MAPK信号通路和JAK/STAT信号通路。此外，还诱导了细胞因子-细胞因子受体相互作用、自然杀伤细胞介导的细胞毒性和Toll样受体信号通路等与天然免疫相关的信号通路。根据Pearson相关系数和TargetScan和miRanda预测结果，构建了NFKB1、IFNAR2和IL10RB的miRNA-mRNA网络，并用qPCR方法在山羊成纤维细胞中进行了验证，证明山羊成纤维细胞具有免疫调节特性。我们的研究结果为进一步深入了解宿主miRNA驱动的羊疫霉防御机制提供了依据，并揭示了山羊对羊疫霉感染的天然免疫和适应性免疫应答中转录组的变化。

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