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R3区域是人类疱疹病毒6的三个主要重复区域之一,是立即早期基因U95的强增强子。( The R3 region, one of three major repetitive regions of human herpesvirus 6, is a strong enhancer of immediate-early gene U95. )
M Takemoto T Shimamoto Y Isegawa K Yamanishi DNA, Viral Enhancer Elements Genetics Genes, Immediate-Early Genes, Viral DNA, 病毒 基因, 即早 基因, 病毒 疱疹病毒6型, 人 重复序列, 核酸
人疱疹病毒6型(HHV-6)的一个即刻早期(IE)基因U95与鼠巨细胞病毒(MCMV)的IE2基因在氨基酸水平上具有相似性,并与人巨细胞病毒(HCMV)的US22基因家族相关。对U95的cDNA克隆进行序列分析,发现U95的转录起始位点位于ATG的上游约1.6kbp,转录产物由两个外显子组成。从142589个核苷酸延伸到144229个内含子,含有ORF U94。在体外转录-翻译分析中,从该cDNA克隆中翻译出一个分子量约为120kDa的蛋白质。引物延伸分析发现转录起始位点位于R3区下游220 bp。HHV-6在IE-A基因座内或附近有三个重复元件R1、R2和R3。R3由一个104-107-bp序列元件的24个拷贝组成,含有AP2和NF-kappaB等细胞转录因子的多个推测结合位点,其生物学意义尚待阐明。本研究分析了与U95转录起始位点相对的-710-+46之间的区域。从-710到-396(对应于一个R3单元的三个拷贝)的缺失使启动子活性降低了15倍,而IkappaBalpha(S32A/S36A)的共表达将其抑制到几乎相同的水平。电泳迁移率变化分析表明NF-kappaB家族成员p50和c-Rel与R3区的NF-kappaB位点结合。这些结果表明R3能显著增强U95启动子的活性,R3区NF-kappaB和NF-kappaB的结合位点在U95启动子的激活中起重要作用。由于U95启动子的活性与R3单元的数目相关,每个R3单元包含一个NF-kappaB位点,因此R3的重复组织对于调节U95转录是重要的。
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