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微生物质粒基因组学:基于复制和转移系统和宿主分类学的分类和鉴定( Genomics of microbial plasmids: classification and identification based on replication and transfer systems and host taxonomy )
M Shintani ZK Sanchez K Kimbara plasmid host replication conjugative transfer Inc group
质粒是细菌间传递遗传信息的重要“载体”。质粒的交换将致病性和环境相关特性传递给宿主菌,促进宿主菌快速进化和适应各种环境。在过去的60年里,从不同的微生物中鉴定和分离出了大量的质粒。随着测序技术的革命,在细菌、古细菌和真核生物中发现的4600多个质粒的完整序列已经被确定。对各种质粒的分类不仅对了解它们的特征、宿主范围和微生物进化很重要,而且对有效地利用它们作为微生物工程的遗传工具也是必要的。本文从宿主分类、复制和接合转移特性等方面综述了全测序质粒的分类研究现状。大多数完全测序的质粒存在于变形菌门、硬枝菌门、螺旋体门、放线菌门、蓝藻门和欧氏菌门的细菌中,并包括了每个门的关键特征。本文还讨论了近年来在利用自然环境样品鉴定新类型质粒和利用培养无关的方法转移质粒方面的进展。
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