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肺腺癌焦亡相关预后基因特征及相关调控轴的鉴定( Identification of the pyroptosisrelated prognostic gene signature and the associated regulation axis in lung adenocarcinoma )
Wanli Lin Ying chen Bomeng Wu Zuwei Li
肺腺癌(LUAD)仍然是最常见的致命疾病,预后不良。焦下垂可以调节肿瘤细胞的增殖、侵袭和转移,从而影响肿瘤患者的预后。然而,焦下垂相关基因(PRGs)在LUAD中的作用尚不清楚。在我们的研究中,我们进行了综合的生物信息学分析,构建了预后基因模型和ceRNA网络。用Pearson相关分析法评价PRGs与肿瘤免疫浸润、肿瘤突变负担和微卫星不稳定性的相关性。LUAD共有23个PRG上调或下调。总结了LUAD的PRG基因突变变异情况。功能富集分析表明,这33个PRGs主要参与焦下垂、NOD样受体信号通路和Toll样受体信号通路。预后分析显示NLRP7、NLRP1、NLRP2和NOD1低表达而CASP6高表达的LUAD患者存活率较低。用上述5个预后基因构建的PRG预后模型可预测LUAD患者的总生存率,准确率为中高。PRGs的预后与免疫细胞浸润、肿瘤突变负担和微卫星不稳定性之间有显著的相关性。构建ceRNA网络,鉴定LUAD中lncRNA KCNQ1OT1/miR-335-5P/NLRP1/NLRP7调控轴。总之,我们进行了全面的生物信息学分析,并确定了包含五个基因(NLRP7,NLRP1,NLRP2,NOD1和CASP6)的LUAD患者的PRG预后特征。我们的结果还发现了lncRNA KCNQ1OT1/miR-335-5P/NLRP1/NLRP7调控轴,该轴可能在LUAD的进展中起重要作用。需要进行进一步的研究来验证这一结果。
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