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人类背外侧前额叶皮层转录组尺度的空间基因表达( Transcriptome-scale spatial gene expression in the human dorsolateral prefrontal cortex )
KE Maynard L Collado-Torres LM Weber C Uytingco AE Jaffe
我们使用10x Genomics Visium平台定义了六层人背外侧前额叶皮层(DLPFC)基因表达的空间地形。我们鉴定了广泛的层状丰富的表达特征，并改进了与先前层状标记的关联。我们将我们的层状表达特征叠加到大规模的单核RNA测序数据上，增强了表达驱动簇的空间注释。通过整合神经精神障碍基因集，我们显示了与精神分裂症和自闭症谱系障碍相关的基因的差异层富集表达，突出了空间定义表达的临床相关性。然后我们开发了一个数据驱动的框架来定义空间转录组学数据中的无监督聚类，这些聚类可以应用于形态结构不像皮层那样定义得很好的其他组织或大脑区域。最后，我们为科学界创建了一个web应用程序，以探索这些原始和汇总的数据，以增强正在进行的神经科学和空间转录组学研究（http://research.libd.org/spatiallibd）
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