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非洲肺鱼基因组揭示了脊椎动物从水到陆地的转变( African lungfish genome sheds light on the vertebrate water-to-land transition )
K Wang J Wang C Zhu L Yang W Wang
肺鱼是四足动物现存的近亲，保存着与水到陆地过渡有关的祖先特征。然而，它们巨大的基因组大小阻碍了对进化中这一关键转变的理解。在此，我们报告了非洲肺鱼（Protopterus annectens）基因组的一个40Gb染色体水平的组装，这是迄今为止报道的最大的基因组组装，其连接和染色体N50分别为1.60Mb和2.81Gb。肺鱼基因组的大尺寸主要是由于反转录转座子。具有超长长度的基因显示出与其他基因相似的表达水平，表明肺鱼进化出保持基因表达平衡的高转录效能。结合转录组和实验数据，我们确定了与肺表面活性物质、抗焦虑能力、五指肢和咽重塑等陆生适应特性相关的潜在基因和调控元件。我们的结果为理解从鱼类到人类的进化路径提供了见解和关键资源。
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