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在家蚕中,转录因子BR,想要靶基因的ide鉴定( Genome﹚ide identification of target genes for transcription factor BR〤 in the silkworm, Bombyx mori )
M Guo W Qian X He J Peng D Cheng BR〤 ChIP﹕eq direct binding silkworm target genes transcriptional regulation
转录因子广泛复合体(BR)是昆虫蜕皮激素的主要应答基因,参与昆虫生长发育的调控。本研究利用染色质免疫沉淀和高通量测序(Chip:EQ)对家蚕BR基因进行了基因组鉴定。结果共鉴定出1006个BR芯片峰,15%的峰位于133个蛋白ODING基因的启动子区。功能注释表明,这些芯片峰ssociated基因作为潜在的BR靶点,富集于与生物合成、代谢和发育相关的途径中。转录组分析和实时定量聚合酶链反应(PCR)检测显示,部分潜在的BR靶点,包括HR96和GC,在发育过程中表达模式的变化与BR相似。Chip linocr检测证实BR可以直接结合到潜在靶点的启动子上。此外,双荧光素酶检测表明,随着BR的过度表达,HR96启动子的活性显著提高,而当启动子中的结合基序被截断时,这种上调被取消。本研究将有助于揭示BR在昆虫生长发育过程中的调控作用。
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