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转录组学分析为马尼拉蛤Ruditapes菲律宾蛤的生长提供了候选基因和分子途径的见解( Transcriptomic analysis provides insights into candidate genes and molecular pathways involved in growth of Manila clam Ruditapes philippinarum )
H Nie M Zheng Z Wang Q Xu X Yan
生长是水产养殖育种方案中最重要的性状之一。理解个体之间生长差异的机制有助于通过更有效的育种方案提高生长速度。菲律宾蛤仔是一种具有重要经济价值的海洋双壳类动物。为了深入探讨海洋贝类生长变异的分子机制，我们对菲律宾蛤仔进行了转录组测序，并对其生长相关基因的表达差异及与生长性状相关的分子途径进行了研究。本研究通过RNA-seq和qPCR分析，研究了马尼拉蛤快速生长和缓慢生长的分子和基因表达差异，重点分析了与生长相关的特定基因的差异表达模式。共获得61个差异表达基因（DEGs）显著差异表达，分为Ras信号通路、hedgehog信号通路、AMPK信号通路、p53信号通路、肌动蛋白骨架调控、粘着斑、mTOR信号通路、VEGF信号通路和TGF-β信号通路。在菲律宾蛤仔快速生长和缓慢生长阶段，共有34个生长相关基因得到显著验证和上调/下调。功能富集分析表明，胰岛素信号通路、PI3K-Akt信号通路和mTOR信号通路在菲律宾蛤仔的分子功能和生长特性调控中起着关键作用。所获得的生长相关基因和途径为研究海洋双壳类的生理适应、代谢活动和生长变异性的分子基础提供了重要的见解。
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