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自噬相关基因对标记肝细胞癌的预后( Autophagy-Related Gene Pairs Signature for the Prognosis of Hepatocellular Carcinoma )
Yiming Luo Furong Liu Shenqi Han Yongqiang Qi Zhiwei Zhang
肝细胞癌(HCC)已被公认为全球癌症相关死亡的第三大原因。越来越多的证据表明,自噬相关基因的异常表达在HCC的发生发展中起着重要作用。因此,对自噬相关基因的研究可以进一步阐明癌症的遗传驱动因素,为临床治疗提供有价值的治疗靶点。本研究利用从人类自噬数据库(HADb)和分子签名数据库(MSigDB)中提取的232个自噬相关基因构建了1884个自噬相关基因对。在此基础上,我们利用最小绝对收缩和选择算子(LASSO)Cox回归建立了一个基于自噬相关基因对的预后模型,以评估肝癌切除术后患者的预后。然后,我们使用来自三个不同数据库的845例肝癌样本,通过生存分析、受试者操作特性(ROC)曲线分析、单变量和多变量分析来检验风险特征的可靠性。为了进一步探索其生物学机制,我们对自噬相关基因进行了富集分析。最后,我们将特征与独立的预后因素结合起来构造一个诺模图。根据自噬相关基因对(ARGP)的特征,我们可以将患者分为高危险组和低危险组。生存分析和ROC曲线分析验证了签名的有效性(AUC:0.786-0.828)。多因素Cox回归分析表明,危险度评分可作为肝癌患者临床结局的独立预测指标。值得注意的是,该模型比大多数预测肝癌预后的模型具有更准确的预测效果。此外,我们的模型是肝癌分期指标的有力补充,包含两个指标的诺模图可以提供更好的预后效果。基于对多个自噬相关基因,我们提出了一个预测肝癌患者术后总生存率的预后模型,这是一个有希望的预后指标。该研究证实了自噬在HCC发生发展中的重要性,也为靶向治疗提供了潜在的生物标志物。
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