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对MicroRNA转录本的网络分析揭示了胃癌血管生成的相关MicroRNA和候选基因( Network analysis of MicroRNA transcripts revealed relevant MicroRNAs and gene candidates for angiogenesis in gastric cancer )
AR Nath J Natarajan
背景血管生成被认为是癌症进展的标志之一。目的：研究胃癌血管生成的microRNAs（miRNAs）及其靶基因和途径。方法从胃癌正常、癌旁和癌旁三种情况的miRNA转录谱中，筛选出癌旁正常[adj-nor]、癌旁[tum-adj]和癌旁[tum-nor]三种情况下存在差异表达的miRNA，预测这些miRNAs的靶基因并进行网络分析。通过功能富集分析和途径分析对所得到的子网络簇进行注释，以确定与胃癌血管生成相关的潜在基因和途径。结果本研究鉴定了2个miRNAs(miR-196a-5p和miR-223-3p)、12个基因(IL6、SP1、STAT3、FBXW7、STAT1、STAT5A、ZEB1、HMOX1、CCND1、CDKN1B、GLMN和PRDM1)和1条与胃癌血管生成相关的信号通路（FoxO信号通路）。其中5个基因(HMOX1、CCND1、CDKN1B、GLMN和PRDM1)在胃癌血管生成中的作用为首次报道。结论血管生成是肿瘤发生发展的关键步骤，进一步研究这两个miRNAs和5个靶基因及其途径将有助于胃癌的早期发现、诊断和治疗。
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