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选择基于结构的虚拟筛选的机器学习评分功能( Selecting machine-learning scoring functions for structure-based virtual screening )
PJ Ballester
对对接技术的兴趣与大分子治疗靶点的3D模型的数量和多样性同步增长。基于结构的虚拟筛选(SBVS)旨在利用这些实验结构来发现药物发现过程的必要起点。目前,机器学习(ML)通过利用目标、分子及其关联的大量数据集,可以大大提高SBVS评分函数的预测精度。然而,随着更多的选择,基于ML的评分函数最适合在给定目标上的预期使用的问题变得越来越重要。在这里,我们分析了为目标选择一个现有评分函数的两种方法,以及第三种方法,其中包括生成一个为目标量身定制的评分函数。这些分析需要讨论流行的SBVS基准的局限性、SBVS基准评分函数的替代方法以及如何生成它们或使用免费软件。
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