对小球藻病毒PBCV-1基因组右侧的74kb DNA进行分析。

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作者：scidown 发布时间：2021-07-11 17:39:46 文章标题：

对小球藻病毒PBCV-1基因组右侧的74kb DNA进行分析。( Analysis of 74 kb of DNA located at the right end of the 330-kb chlorella virus PBCV-1 genome. )

文章作者：

L Yu Z Lu L Sun S Ropp GF Kutish DL Rock JLV Etten Chlorella Phycodnaviridae DNA, Viral Genes, Viral Genome, Viral Molecular Sequence Data

文章简述：

本文完成了对小球藻病毒PBCV-1基因组330,740bp序列的初步分析，这是迄今为止测序的最大的病毒基因组。PBCV-1基因组是最小的自我复制生物生殖支原体基因组大小的57%。对来自PBCV-1基因组右端的74 kb新测序DNA的分析显示，有153个65个密码子或更长的开放阅读框（ORF）。这些ORF中有85个均匀分布在DNA的两条链上，被认为是主要的ORF。59个主要ORF的分离小于100个bp。最大的基因间距离为729 bp，发生在位于PBCV-1基因组2.2kb反向末端重复区的两个ORF之间。85个主要ORF中有27个与数据库相似，包括核糖核苷酸二磷酸还原酶大亚基、ATP依赖性DNA连接酶、II型DNA拓扑异构酶、解旋酶、组氨酸脱羧酶、dCMP脱氨酶、dUTP焦磷酸酶、增殖细胞核抗原、转座酶、真菌翻译伸长因子3(EF-3)、UDP葡萄糖脱氢酶、蛋白激酶、腺嘌呤DNA甲基转移酶及其相应的DNA位点特异性核酸内切酶。153个ORF中有17个与其他PBCV-1 ORF相似，表明它们代表基因复制或基因家族。

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