与TCF19表达相关的基因变异与中国人群的头颈癌风险有关( Genetic variants associated with expression of TCF19 contribute to the risk of head and neck cancer in Chinese population )

P Ji J Chang X Wei X Song H Ma

背景头颈部鳞状细胞癌(SCCHN)是世界上最常见的癌症之一，包括发生于口腔、咽和喉的癌症。全基因组关联研究发现了几个与SCCHN风险相关的遗传变异；然而，它们只能解释遗传力的一小部分。因此，有更多的易感基因座需要鉴定。方法对555例SCCHN患者和1367例正常人进行基因分型的关联研究。对63个373个SNPs进行了单变量关联分析，并通过1875例SCCHN和4637例对照的两阶段验证确定了有希望的变异。应用生物信息学分析和功能分析，揭示了与SCCHN相关的有希望的变异体和基因的潜在致病机制。结果我们首次发现了3个与SCCHN风险相关的新的遗传变异(rs2517611在6p22.1处P=7.45×10,rs2524182在6p21.33处P=1.76×10,rs3131018在6p21.33处P=2.17×10)。进一步分析和生化检测表明，rs3094187与rs3131018处于高度连锁不平衡区，可通过调节转录因子SREBF1与TCF19启动子的结合亲和力来修饰TCF19的表达。此外，实验还表明，TCF19的抑制可能影响肿瘤发生的几个重要途径，并减弱SCCHN的细胞增殖和迁移。结论：功能性遗传变异可能参与SCCHN的发生，TCF19可能是SCCHN的易感基因。

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