染色体问到埃维尔•茶尺蠖的参考基因组和基因组编辑( Chromosome﹍evel genome reference and genome editing of the tea geometrid )

Y Pan G Fang Z Wang Y Cao S Zhan Chromosome﹍evel genome genome editing genome synteny Hox genes the tea geometrid

茶尺蠖是茶树上的一种破坏性害虫，严重危害茶叶的产量和品质，造成严重的经济损失。茶尺蠖也为探讨其独特的寄主植物适应和保护相似性背后的生态适应机制提供了一个重要的研究系统。在本研究中，我们充分利用长时间的测序读数，对茶尺蠖Ectropis grisescens的参考基因组进行了测序和从头组装。我们提供了一个高度连续的近omplete基因组参考文献(787.4Mb；支架N50:26.9Mb),注释了18746个蛋白Oding基因和53.3%的重复序列。重要的是，我们成功地将97.8%的装配在31条基于HI相互作用的染色体上，并基于性别偏见测序覆盖率对性染色体进行了定性。多质量控制试验和染色体：cale与模式种的同步性都支持所提出的基因组参考文献的高质量。我们对茶尺蠖中与寄主植物适应和伪装有关的基因家族进行了生物学注释，并与其他具有代表性的鳞翅目进行了比较。重要的发现包括Grisescens:CYP6，P450基因的特异扩展，可能涉及茶叶防御化学物质的代谢，以及味觉受体基因家族的意外大规模扩展，表明这种茶害虫的多食潜力。此外，我们开发了一个基于CRISPR/Cas9技术的高效基因组编辑系统，并成功地实现了茶尺蠖Hox基因的诱变。本研究为探索茶树几何虫生态适应的独特机制和开发环境友好型茶树害虫防治策略提供了重要的基因组资源。

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