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基于光亲和的蛋白质组学识别聚腺苷二磷酸核糖结合蛋白( Identifying Poly(ADP-ribose)-Binding Proteins with Photoaffinity-Based Proteomics )
M Dasovich MQ Beckett S Bailey SE Ong AKL Leung
聚ADP-核糖(PAR)对蛋白质的翻译后修饰是DNA损伤反应的重要组成部分。四种PAR合成抑制剂最近被批准用于乳腺癌、卵巢癌和前列腺癌的治疗。尽管PAR具有临床意义，但对其功能的分子理解，包括其结合伙伴，仍然不完整。在本工作中，我们合成了一种捕获和分离内源性PAR结合物的PAR光亲和探针。我们的方法鉴定了几十种已知的PAR结合蛋白和数百种参与DNA修复、RNA处理和代谢的新候选蛋白。用下拉和/或电泳迁移率转移分析证实了八个候选PAR结合。通过使用特定长度的PAR探针，我们检测到了与40-mer相对于8-mer PAR优先结合的蛋白质，表明聚合物长度可能调节PAR信号通路的结果和时间。这项研究首次对PAR结合蛋白进行了普查，提供了长度选择性PAR结合的蛋白质组学分析，并将PAR结合与RNA代谢和生物分子缩合物的形成联系起来。
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