通过比较蛋白质组学分析了解海洋生物膜形成假单胞菌分离物的浮游到固着过渡( Insights into the planktonic to sessile transition in a marine biofilm-forming Pseudoalteromonas isolate by comparative proteomic analysis )

Z Wu Y Wu Y Huang J He D Feng

细菌生物膜在海洋生物污损中起着重要作用。当海洋细菌细胞从浮游状态过渡到附着状态时，生物膜的形成就开始了。然而，参与这一转变的分子机制尚不清楚。在这里，从生长在水下人工表面（玻璃载片、环氧板和桥柱）上的天然生物膜中分离出51株海洋细菌，并对其生物膜形成能力进行了评价。16S rRNA基因序列分析表明,11株菌株分别属于Leisingera属、Roseobacter属、Pseudoalteromonas属、Alteromonas属、Tenacibulum属、Vibrio属、Chryseobacterium属、Aquimarina属、Acinetobacter属。假交替单胞菌。W-7显示出高效和快速的附着，因此被选作进一步的研究。以ITRAQ为基础对浮游和附着菌株W-7细胞进行了比较蛋白质组学分析。共鉴定出3468个蛋白，其中163个蛋白表现出显著差异表达（相对于浮游细胞，附着细胞中120个表达下调，43个表达上调）。KEGG（Kyoto encyclopedia of genes and genomes）分析表明，在附着细胞中丙酮酸代谢、碳固定和碳代谢受到显着影响。UTP-葡萄糖-1-磷酸尿苷基转移酶、丙酮酸脱氢酶复合物的乙酰转移酶组分、OmpA样蛋白和乙酰辅酶A合成酶等上调蛋白可能在初始粘附过程中起重要作用。我们的发现提供了对海洋污损细菌浮游到固着转变的更深入的理解。

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