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研究环状rna -蛋白相互作用的方法( Methods to study circRNA-protein interactions )
CJ Ulshfer C Pfafenrot A Bindereif T Schneider
近几年来,环状RNA(circRNAs)得到了广泛的研究,揭示了其在多种细胞类型和生物体中的功能作用。如少数病例所示,这些功能可能由反式作用因子介导,特别是RNA结合蛋白(RBPs)。然而,大多数circRNAs的具体互动伙伴仍不清楚。这主要是由于在确定它们以及在区分circRNAs的相互作用体和它们的线性对应体之间存在技术困难。本文综述了目前系统研究circRNA-蛋白质复合物(circRNPs)的方法学,主要集中在基因特异性或全局水平上的特定RNA或蛋白质,并讨论了现有方法的优点和挑战。
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