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阐明了结构波动、分子间和电子间相互作用在细菌植物色素光谱响应中的作用( Elucidating the role of structural fluctuations, and intermolecular and vibronic interactions in the spectroscopic response of a bacteriophytochrome )
V Macaluso L Cupellini G Salvadori F Lipparini B Mennucci
我们首次对耐辐射球菌光敏色素静息状态的共振拉曼光谱、吸收光谱和圆二色光谱进行了全面的多尺度计算研究。对光谱的所有成分,即远红带和远蓝带的能量位置和线形进行了模拟。为了实现这一目标,我们将4.5μs的溶剂化二聚光敏色素的MD模拟与混合量子力学/分子力学(QM/MM)模型相结合,该模型考虑了QM和MM子系统之间的静电和互极化效应。三种光谱与实验结果吻合较好。此外,我们在胆绿素生色团的结合口袋中发现了一个瞬态的氢键网络,出乎意料地,它对光谱没有明显的影响。同时,我们表征了与胆绿素激发耦合更强的振动,证实了其乙烯基C-H的氢离面模式以及双键的预期CC伸展在光异构化中的重要作用。
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