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新不列颠海沟垂直水体中互交假单胞菌的种群结构、活动潜力和生态型划分( Population structure, activity potential, and ecotype partitioning of Pseudoalteromonas along the vertical water column of the New Britain Trench )
Wei Wenxia Wang Li Fang Jiasong Liu Rulong Deep-sea Pseudoalteromonas structure activity ecotype partitioning
有机物沿水柱垂直剖面的微生物降解是驱动海洋碳循环的一个主要过程。假交替单胞菌是全球远洋海洋环境中的优势菌属,在有机碳再矿化中发挥着重要作用。然而,目前对假交替单胞菌的认识主要基于浅水种群或栽培种。本研究首次分析了新不列颠海沟6000米以下水柱中假交替单胞菌的结构、活动潜力和生态型分化。对16S rRNA基因及其转录本的多样性分析表明,假交替单胞菌在深海水体中富集,具有很高的活性潜力。深海假交替单胞菌与浅水假交替单胞菌有显著差异,表明在垂直剖面上存在明显的生态型划分。对来自不同深度的219株假交替单胞菌16S rRNA基因和hsp60基因的系统发育分析进一步表明,菌株水平上甚至可以发生垂直生态型划分,这可能是长期适应不同深度环境条件的结果。发现的深度特异菌株为进一步研究深海假交替单胞菌的适应、进化和生态功能提供了有价值的模型。
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