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野生型和实验室减毒狂犬病病毒感染小鼠大脑中lncRNA和mRNA表达的比较( Comparison of lncRNA and mRNA expression in mouse brains infected by a wild-type and a lab-attenuated Rabies lyssavirus )
B Sui D Chen W Liu B Tian L Zhao
狂犬病是由狂犬病lyssavirus,俗称狂犬病毒(RABV)引起的一种致死性疾病,一旦人和动物出现临床症状,就会导致近100%的死亡。长非编码RNAs(lncRNAs)已被报道与病毒感染有关。但lncRNAs在RABV感染中的作用尚不明确。本研究利用下一代测序技术,对野生型(WT)和实验室减毒RABV感染鼠脑的lncRNA和mRNA表达谱进行了全局转录组分析。用edgeR软件包分析差异表达的lncRNAs和mRNAs。通过比较WT和实验室减毒的RABV感染脑,我们鉴定了1422个差异表达的lncRNAs和4475个差异表达的mRNAs。然后利用基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)数据库,根据差异表达的lncRNAs和mRNAs预测富集的生物学途径。我们的分析揭示了lncRNA与RABV感染相关的免疫应答和离子转运相关通路之间的关系,从而为lncRNA在WT RABV诱导的免疫逃避和神经元损伤中的潜在作用提供了新的见解。
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