眼科:一个将视觉研究转化为临床的眼科疾病的集成知识库( OphthatomeTM: An integrated knowledgebase of ophthalmic diseases for translating vision research into the clinic )

P Raj S Tejwani D Sudha NB Muthu S Nagaswamy

背景医学大数据分析通过引入有助于基础临床决策、疾病进展和管理的预测或预后建模、疾病监测、对公共卫生的影响和研究的过程，彻底改变了人类医疗保健系统。尽管电子病历(EMR)系统是多年来收集的大量患者队列的丰富医疗数据的数字仓库，但这些数据缺乏足够的结构，无法对应用深度学习方法和高级分析来改善单个患者或整个学科的疾病管理具有任何临床价值。Ophthatome捕获了2012年9月至2018年1月期间的回顾性电子医疗记录中包含的数据，以通过眼病知识库促进平移视力研究。方法将MS-SQL数据库中记录的Narayana Nethralaya的电子病历数据进行映射，并编程转移到MySQL数据库中。捕获的数据经过人工整理，以保持数据的完整性和准确性。数据存储在MySQL数据库管理系统中，便于可视化、高级搜索功能和其他知识库应用。结果Ophthatome是一个全面而准确的眼科疾病知识库，包含2012年9月至2018年1月期间记录的印度人口581,466例眼科病例的精心策划的临床、治疗和影像学数据。Ophthatome提供过滤器和布尔搜索与操作符和修改器，允许选择特定队列，涵盖524种不同的眼科疾病类型和1800种疾病亚型，横跨35个不同的解剖区域的眼睛。大约30万受试者的纵向数据提供了额外的机会来进行关于疾病进展和管理的临床研究，包括药物反应和治疗结果。knowledgebase收集了不同基因人群中的眼病，为研究导致或影响眼病的基因和环境因素提供了机会。结论Ophthatome将促进眼科疾病的临床研究、基因组研究、药物基因组学研究和高级翻译研究。

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