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海洋溢油区海洋微生物活动的功能宏基因组和富集宏转录组分析( Functional metagenomic and enrichment metatranscriptomic analysis of marine microbial activities within a marine oil spill area )
BSA B ZL A LA Si ZZ A QF A SW A LA Liang SQ A
微生物降解石油烃具有成本低、对生态系统副作用小等优点。本研究利用宏基因组学和元翻译组学方法对微生物降解海洋石油烃的机理进行了研究,以期为微生物降解海洋石油烃提供新的认识。在渤海湾钻井平台附近8米处采集海水样品,利用宏基因组测序方法对这些海洋微生物群落的功能潜力进行了评价。还对12种不同培养条件下样品的微生物群落进行了Metatranscriptomic测序、荧光原位杂交实验和流式细胞术。数据还进行加权基因共表达网络分析(WGCNA)和共转录数据可视化,以评估基因功能的共转录。宏基因组测序表明存在大量与石油烃代谢相关的基因。此外,基因在多个途径中的高共转录,表明一组基因协同转录以代谢石油烃。Metatranscriptomics还显示微生物代谢在富集中高度活跃,大量原核复制和修复基因的转录显著上调,包括编码T6SS蛋白、DNA聚合酶I、胸苷磷酸化酶、甲羟戊酸激酶和双组分系统的基因。与之相伴的是,参与翻译的核糖体基因和参与能量代谢的光合基因转录下调。总体而言,油和氧的存在可以提高油降解率和相关基因的转录。许多不同的新陈代谢被共同调节以开发从石油碳氢化合物的新陈代谢中获得的营养物质。本研究通过对宏基因组、宏全谱和降解数据的分析表明,参与石油降解的基因谱分布广泛,基因间的协同作用十分重要。
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