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分子动力学模拟和药物发现( Molecular dynamics simulations and drug discovery )
JD Durrant JA Mccammon virtual screening free-energy prediction cryptic binding sites computer-aided drug discovery molecular dynamics simulations allosteric binding sites Biological Sciences(General
本文综述了原子计算机模拟大分子(如蛋白质)受体及其相关小分子配体在药物发现中的许多作用,包括识别隐秘或变构结合位点、增强传统虚拟筛选方法、直接预测小分子结合能等。本文还讨论了现有模拟方法的局限性,包括计算成本高和需要近似分子力等。随着计算机能力和算法设计的不断提高,计算机辅助药物设计的发展前景广阔;分子动力学模拟有可能发挥越来越重要的作用。
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