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恶性疟原虫红细胞内发育周期的转录组研究。PLoS biology: 10.1371/ journal.pbio.0000005( The transcriptome of the intraerythrocytic developmental cycle of Plasmodium falciparum. PLoS Biol 1: 10.1371/ journal.pbio.0000005 )
Z Bozdech M Llinás BL Pulliam ED Wong J Zhu JL Derisi
恶性疟原虫是最严重的人类疟疾的病原体，每年影响全世界2亿至3亿人。最近对恶性疟原虫基因组测序发现了5400多个基因，其中60%编码功能未知的蛋白质。对这些基因的生化功能和调控的深入了解将为今后根除该病的药物和疫苗开发工作提供基础。通过对恶性疟原虫HB3株完整的无性红细胞内发育周期(IDC)转录组的分析，我们证明至少60%的基因组在此阶段具有转录活性。我们的数据表明，这种寄生虫已经进化出一种极其专门化的转录调节模式，产生一个连续的基因表达级联，开始是与一般细胞过程相对应的基因，如蛋白质合成，结束是疟原虫特有的功能，如参与红细胞入侵的基因。这些数据表明，沿着染色体相邻的基因很少是共调控的，而来自质体基因组的转录是高度共调控的，并且可能是多顺反子的。在HB3和参考基因组株(3D7)之间进行比较基因组杂交，以区分在IDC期间未表达的基因和由于可能的序列变异而未检测到的基因。这些菌株之间的基因组差异几乎只发现在染色体的高抗原性亚端粒区域。恶性疟原虫无性发育的简单的基因调控级联在真核生物生物学中是前所未有的。IDC转录组
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