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分枝杆菌鉴定的两实验室合作研究:分子与表型方法。( Two-laboratory collaborative study on identification of mycobacteria: molecular versus phenotypic methods. )
B Springer Humans Mycobacterium Mycobacterium Infections DNA Primers DNA, Bacterial RNA, Ribosomal, 16S Sensitivity and Specificity Polymerase Chain Reaction Phylogeny Base Sequence
以往的研究表明,用于鉴定分枝杆菌的常规试验可能(1)经常导致错误的鉴定,(2)低估分枝杆菌属内的多样性。为了更系统地解决这一问题,开展了一项比较分枝杆菌表型和分子鉴定方法的研究。重点是难以鉴定到种级的分离物,以及在日常常规实验室条件下进行的常规试验不能得出结论性结果的分离物。传统的方法包括生长速率、菌落形态、色素沉着、生化谱和气液相色谱。通过PCR介导的16S rRNA基因部分序列分析进行分子鉴定。本研究共包括34株分离物;其中13个分离物对应于已建立的种,21个分离物对应于以前未鉴定的分类群。对5个分离株,表型分析和分子分析给出了相同的结果。5个分离物存在轻微差异;经生化检测后仍有4株分离物未鉴定。对20株分离物,传统分型方法和分子分型方法之间存在较大差异。回顾性分析结果显示,差异结果无一例外是由于错误的生化检验结果或解释。特别是,表型鉴定方案在识别以前未描述的分类群方面受到损害。我们认为,用16S rRNA序列测定分子分型不仅比传统分型更快速(12-36 h而不是4-8周),而且更准确。
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