利用Nave贝叶斯分类器识别蛋白质-蛋白质相互作用中涉及的界面残基

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作者：scidown 发布时间：2023-01-01 11:55:29 文章标题：

利用Nave贝叶斯分类器识别蛋白质-蛋白质相互作用中涉及的界面残基( Identification of Interface Residues Involved in Protein-protein Interactions Using Nave Bayes Classifier )

文章作者：

C Wang J Cheng S Su D Xu Naï ve Bayes classifier Protein-protein interactions Residue accessible surface area Sequence profile

文章简述：

蛋白质-蛋白质相互作用界面残基的识别在药物合理设计和代谢等方面有着广泛的应用。提出了一种具有蛋白质序列谱和残基可及表面积特征的蛋白质-蛋白质相互作用界面残基预测的NaiveBayes分类器。该方法充分利用了NaiveBayes分类器假设给定类别的属性独立性的特点。在仅由异源复合蛋白质组成的多样性数据集上，通过留一交叉验证估计，识别界面残基的总体准确率为68.1%，相关系数为0.201，特异性为40.2%，灵敏度为49.9%。这一结果表明该方法的性能明显优于机会（零相关）。在蛋白质三维结构的背景下对预测的检验证明了该方法在识别蛋白质-蛋白质位点方面的有效性。

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