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旁遮普Pectobacterium punjabense sp. nov.，从巴基斯坦马铃薯黑腿病植株中分离。( Pectobacterium punjabense sp. nov., isolated from blackleg symptoms of potato plants in Pakistan. )
Sohaib Sarfraz Kashif Riaz Sad Oulghazi Jérémy Cigna Shahbaz Talib
从巴基斯坦旁遮普省平原区Chiniot地区的马铃薯田中分离到1株果壳杆菌菌株SS95T、SS54和SS56。gapA条形码序列分析表明,这些菌株属于一个新的系统发生类群,该类群是从山葵外杆菌和帕氏胸杆菌中分离出来的。此外,对13个看家基因(fusA、rpoD、acnA、purA、gyrB、recA、mdh、mtlD、groEL、secY、glyA、gapA和rplB）的多位点序列分析表明,SS95T菌株与近缘菌株parmentieri RNS 08-42-1AT和山葵P.wasabiae CFBP3304T以及其他已知的胸杆菌属有明显的区别。在SilicoDNA-DNA杂交中（T与其它胸杆菌型菌株进行了比较，支持了对一个新种的描述。基因组和表型的比较使巴基斯坦分离物与所有其它已知胸杆菌型菌株区别开来的其他性状得以鉴定。本分类群的命名为Pectobacterium punjabense sp.nov.的类型菌株为SS95T(=CFBP8604T=LMG30622T)。
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