水稻和玉米GBSS酶基因组同源建模、功能标注和比较基因组分析。

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作者：scidown 发布时间：2021-06-15 16:32:58 文章标题：

水稻和玉米GBSS酶基因组同源建模、功能标注和比较基因组分析。( Homology modeling, functional annotation and comparative genome analysis of GBSS enzyme in rice and maize genomes. )

文章作者：

JI Wattoo MS Iqbal M Arif Z Saleem M Iqbal enzymes genes genomes maize nucleotide sequences phenotypes rice

文章简述：

基因或蛋白质的结构在进化上比DNA序列更保守；因此，利用最新的生物信息学方法在分子水平上进行遗传研究，对于揭示不同表型的遗传基础具有很大的潜力。颗粒结合淀粉合成酶(GBSS)是一种蜡质基因编码的蛋白质，在不同的谷物品种中决定烹饪和食用品质属性。在目前的研究中，我们评估了在两个谷类基因组中从各种数据来源检索到的waxy基因的序列信息。我们解释了水稻和玉米基因组中waxy基因的同源性建模、功能注释和比较基因组分析。在同源性模型的基础上，构建了该基因的三维结构，并对其进行了解释。为验证三维结构的可靠性，进行了多项验证试验。在比较基因组分析中，我们只在水稻蜡质蛋白中发现了保守结构域。这些保守结构域对不同淀粉含量水稻品种的淀粉合成和蜡质基因的遗传具有重要作用。本研究对于阐明GBSS酶和与不同淀粉表型相关的连接蛋白的作用具有明确的意义。对waxy基因结构的更多洞察将导致注释该基因在不同谷类中不同生物途径中的作用。

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