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评估罕见和非编码药物遗传变异的功能后果的计算工具( Computational tools to assess the functional consequences of rare and noncoding pharmacogenetic variability )
Yitian Zhou Volker M. Lauschke Computational Prediction Personalized Medicine Precision Medicine Missense variants Synonymous variants Splice variants
药物反应的个体差异是药物开发和跨层次护理中共同关注的问题。虽然遗传学明显地影响许多药物的药物反应和毒性，但很大一部分可遗传的药理和毒理学变异仍然无法用已知的遗传多态性来解释。近年来,Population：CALE测序项目公布了数万种功能不明确的编码和非编码药物遗传学变异体,这些变异体可能至少部分解释了这种缺失的遗传性。然而，将这些个性化的变异特征转化为药物反应预测和可操作的建议仍然具有挑战性，并构成了当代药物基因组学最重要的前沿之一。传统的预测方法主要基于进化保守性，当应用于保守性较差的药物基因时，其预测精度大大降低。在此，我们回顾了计算变异效应预测器跨变异类的研究现状，并对其在药物基因组学中的应用进行了批判性讨论。除了错义变异外，我们还讨论了同义变异、剪接变异和非编码变异的评价方面的最新进展。此外，我们还讨论了评估单倍型和结构变异的新可能性。我们提倡开发基于药物基因组学而不是病原学数据集训练的算法来提高预测的准确性，以便于利用NGS数据进行个性化的临床决策：支持和精确药物基因组学。
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