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高·以染色体问到埃维尔•的基因组Cucumis metuliferus和Cucumis甜瓜提供洞察Cucumis基因组进化( High﹒uality chromosome﹍evel genomes of Cucumis metuliferus and Cucumis melo provide insight into Cucumis genome evolution )
J Ling X Xie X Gu J Zhao B Xie Cucumis metuliferus Cucumis variation map cucurbit genome evolution resistance‐related gene
非洲角黄瓜（Cucumis metuliferus）是黄瓜（Cucumis sativus,Cucumis sativus,Cucumis melo,melon）的野生近缘种,对几种重要的植物病原（如根线虫和几种病毒）表现出高度的抗性。在这里，我们报道了一个由29039个基因组成的316 Mb基因组序列的metuliferus染色体水平基因组组装。对葫芦科近缘种的系统发育分析表明,葫芦科与甜瓜的分化时间为1780万年前。通过对甜瓜和米氏甜瓜基因组的比较，发现两种甜瓜的8条染色体存在较大的结构变异（倒置和易位>1 Mb）。基因家族比较表明，在葫芦科植物中，米氏葫芦科植物具有最多的抗性相关核苷酸结合位点富亮氨酸重复序列(NBS)RR)基因。大的插入或缺失（indels）引起的NBS®RR位点的丢失和小的indels引起的伪基因化解释了葫芦科NBS®RR基因的丢失。种群结构分析表明，米氏甜瓜原产于津巴布韦，随后传播到南部非洲其他地区，在那里可能经历了与甜瓜相似的家养选择。这一参考序列将加速对抗性相关基因分子进化的理解，并加强葫芦类作物改良的努力。
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