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复壮重构转录网络以改善成熟核桃的根发生( Rejuvenation remodels transcriptional network to improve rhizogenesis in mature Juglans tree )
Song Xiaobo Liu Hao Bu Dechao Xu Huzhi Ma Qingguo Pei Dong adventitious root BGL12 gene regulatory network Juglans rejuvenation
核桃(Juglans L.)的不定根是一个相当困难的问题,特别是对于成熟的树木。通过复壮可以显著提高成熟树的不定根形成能力。然而,返老还童的潜在基因调控网络(GRNs)在很大程度上仍然是未知的。为了研究这些调控网络的特性,我们利用再生和成熟核桃(Juglans hindsii×J.regia)插条底部的形成层和周围组织的RNA样本进行了转录组学研究。RNA测序结果表明,复壮激活了玉米素的生物合成、能量代谢和物质代谢,而抑制了光合作用、脂肪酸的生物合成和次生代谢产物的合成途径。利用差异表达基因构建模块间和模块内GRN。我们鉴定了35个hub基因,涉及ARF相关的5个模块。在这些hub基因中,参与生长素代谢的beta-glucosidase-like(BGLs)家族成员在ARF的早期就有过表达。此外,胡桃楸插条中的BGL12在白杨×腺叶杨中高表达。转基因杨树的ARF加速,ARs数增加。这些结果提供了ARF期间基因活性的高分辨率图谱,有助于揭示与返老还童促进的ARF相关的调控模块。
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