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肠道微生物对宿主免疫激活的快速转录和代谢适应( Rapid transcriptional and metabolic adaptation of intestinal microbes to host immune activation )
S Becattini MT Sorbara SG Kim EL Littmann EG Pamer
肠道微生物群产生代谢物，调节宿主免疫，从而影响疾病的抵抗力和易感性。然而，共生细菌在多大程度上对免疫激活作出交互反应，目前还很难探索。在此，我们用四种厌氧共生体定植小鼠，并表明急性免疫反应导致这些共生体的戏剧性转录重编程，而它们的相对丰度变化很小。转录组的改变包括应激反应介质的诱导和糖降解因子如多糖利用位点（PULs）的下调。鞭毛蛋白和抗CD3抗体这两种截然不同的免疫刺激物诱导了相似的转录谱，提示共生细菌在面对不同的宿主反应时检测共同的效应物或激活共享的通路。免疫激活在6小时内改变了肠道代谢组，使肠内短链脂肪酸含量降低，芳香代谢物含量增加。因此，肠道细菌在可检测到的群落组成变化之前，通过快速改变基因转录和免疫调节代谢产物的产生，对急性宿主免疫激活作出反应。
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