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一种新的环状RNA (hsa_circ_0059930)介导的miRNA-mRNA轴在脂多糖诱导的MRC-5细胞急性肺损伤模型中( A novel circular RNA (hsa_circ_0059930)-mediated miRNA–mRNA axis in the lipopolysaccharide-induced acute lung injury model of MRC-5 cells )
Jianhua Han Shigeng Li Yawei Feng Yufeng He Zhiqiang Ye
环状RNA(circRNA)是一类新发现的具有闭合环状结构的内源性非编码RNA。一些circRNAs已被报道与急性肺损伤(ALI)密切相关。而circRNAs在脂多糖(LPS)诱导的ALI中的表达及其作用尚不完全清楚。首先建立了LPS诱导的MRC-5细胞ALI模型,通过RNA测序分析证实了LPS诱导的MRC-5细胞circRNAs和mRNAs的表达谱。应用基因本体论分析和京都基因和基因组途径百科全书分析方法预测差异mRNAs的潜在功能和途径。hsa_circ_0059930基因敲除后,用CCK-8、流式细胞仪和western blot检测MRC-5细胞的增殖和凋亡。并预测了HSA_CIRC_0059930的网络分析。LPS能明显抑制MRC-5细胞的增殖并诱导其凋亡。在LPS诱导的MRC-5细胞中共发现820个差异circRNAs(560个上调,260个下调)和484个差异mRNAs(240个上调,244个下调)。此外,hsa_circ_0059930在LPS诱导的MRC-5细胞中表达显著上调,敲除hsa_circ_0059930可显著促进LPS诱导的MRC-5细胞增殖,抑制细胞凋亡。并且通过对hsa_circ_0059930的网络分析,我们初步筛选了LPS诱导ALI中潜在的调节轴hsa_circ_0059930/HSA-miR-382-5P/TOP1。我们的数据有助于理解circRNAs和mRNAs在LPS诱导的ALI中的重要性。我们还提供了许多HSA_Circ_0059930介导的microRNA(miRNA)-mRNA轴,特别是HSA_Circ_0059930/HSA-miR-382-5P/TOP1在LPS诱导的ALI中的作用。
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