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系统生物学建模的进展:10年的众包梦想挑战( Advances in systems biology modeling: 10 years of crowdsourcing DREAM challenges )
Pablo Meyer Julio Saez-Rodriguez
计算模型和数学模型是获得对生物过程的系统级理解的关键，但它们的局限性必须明确界定，以允许它们的正确应用和解释。挑战形式的众包基准提供了对方法的公正评估，在过去的十年里，反向工程评估和方法对话(DREAM)组织了超过15次系统生物学挑战。从转录因子结合到动态网络模型，从信号网络到基因调控，从全细胞模型到细胞谱系重建，从单细胞在组织中的定位到药物组合和细胞存活，其广度是广泛的。为了庆祝细胞系统5周年，我们回顾了这些系统生物学挑战的起源，并讨论了正向和反向建模范式的相互联系如何推动系统生物学的边缘。这种方法将在生物学和医学的系统级方法中持续存在。
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